Conclusão.

Conclusão.

Bioinformática corresponde a aplicação das técnicas da Informática, no sentido de análise da informação na área de estudo da Biologia. Uma definição ampla e tentativa é então: (Bio)informática é o estudo da aplicação de técnicas computacionais e matemáticas à geração e gerenciamento de (bio)informação Alguns experts brasileiros da área acreditam que a bioinformática, como se entende tradicionalmente no meio acadêmico e não pela análise da palavra, é circunscrita à Biologia Molecular às vezes ainda mais específicamente restrita à Genômica. Outros acadêmicos, por outro lado, advogam a noção mais abrangente do termo para algo na direção da definição envolvendo informação biológica de modo geral. A Bioinformática combina conhecimentos de química, física, biologia, ciência da computação, informática e matemática/estatística para processar dados biológicos ou biomédicos. Buscando tratar os dados, é necessário desenvolver softwares para, por exemplo: identificar genes, prever a configuração tridimensional de proteínas, identificar inibidores de enzimas, organizar e relacionar informação biológica, simular células, agrupar proteínas homólogas, montar árvores filogenéticas, comparar múltiplas comunidades microbianas por construção de bibliotecas genômicas, analisar experimentos de expressão gênica entre outras inúmeras aplicações.  Bioinformática - Figura 3 – Álbum ANEXO.  Mapa do cromossomo X humano (a partir do site NCBI). Assembléia do genoma humano é uma das maiores conquistas da bioinformática.

A Bioinformática Estrutural pode ser entendida com uma área da Bioinformática responsável pelo estudo de moléculas que possuem estruturas, como por exemplo, DNA, RNA, proteínas e outros compostos menores. Um dos grandes desafios dessa área é compreender como essas moléculas interagem, as suas funções e observar suas estruturas. Algumas técnicas utilizadas são o alinhamento e comparação de sequências. Atualmente, uma das grandes aplicações da Bioinformática Estrutural é o desenvolvimento de novos fármacos, que tem crescido devido ao grande investimento de grandes empresas.  Bioinformática - Figura 4 – Álbum ANEXO. Bioinformática - Figura 5 – Álbum ANEXO. A título de referência para pesquisas dos interessados no assunto, apresento uma lista de laboratórios de bioinformática:  Esta é uma lista de laboratórios de bioinformática no Brasil:

                                                              i.      Pólo de Biologia Computacional e Sistemas- Fiocruz (em português).

                                                            ii.      Centro APTA Citros "Sylvio Moreira" (IAC) (em português).

                                                          iii.      Laboratório de Bioinformática - Centro APTA Citros (em português).

                                                          iv.      Centro de Pesquisas René Rachou - FIOCRUZ-MG (CPqRR) (em português).

                                                            v.      Laboratório de Bioinformática do CPqRR - Dr. Guilherme Oliveira's Lab (em português).

                                                          vi.      CEBio - Centro de Excelência em Bioinformática (em português).

                                                        vii.      Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA) (em português).

                                                      viii.      Laboratório de Bioinformática Aplicada - Embrapa Informática Agropecuária (em português).

                                                          ix.      Laboratório de Bioinformática Estrutural - Embrapa Informática Agropecuária (em português).

                                                            x.      Laboratório de Bioinformática - Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (em português).

                                                          xi.      Laboratório de Bioinformática e Genômica Animal - Embrapa Gado de Leite (em português).

                                                        xii.      Dr. Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da Silva (em português).

                                                      xiii.      Dr. Wagner Arbex (em português).

                                                      xiv.      Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer (ILPC) (em português).

                                                        xv.      Laboratório de Biologia Computacional (em português).

                                                      xvi.      Laboratório Nacional de Computação Científica (LNCC) (em português).

                                                    xvii.      Laboratório de Bioinformática do LNCC (em português).

                                                  xviii.      Nucleo de Genomica e Bioinformatica (NUGEN) - Universidade Estadual do Ceara (UECE) (em português).

                                                      xix.      Laboratório de Bioinformatica e Biologia Computacional, NUGEN/UECE (em português).

                                                        xx.      Universidade de Brasília (UnB) (em português).

                                                      xxi.      Laboratório de Bioinformática (em português).

                                                    xxii.      Universidade Estadual Paulista Campus de Jaboticabal (FCAVJ) (em português).

                                                  xxiii.      Laboratório de Bioquímica de Microrganismos e Plantas (LBMP) (em português).

                                                  xxiv.      Universidade Estadual do Oeste do Paraná (UNIOESTE) (em português).

                                                    xxv.      Laboratório de Bioinformática - LABI (em português).

                                                  xxvi.      Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) (em português).

                                                xxvii.      Núcleo de Biologia Computacional e Gestão de Informações. Biotecnológicas da UESC (em português).

                                              xxviii.      Universidade Federal de Minas Gerais (UFMG) (em português).

                                                  xxix.      Laboratório de Biodados (em português).

                                                    xxx.      Universidade Federal do Pará (UFPA) (em português).

                                                  xxxi.      Laboratório de Genética Humana e Médica (em português).

                                                xxxii.      Bioinformática da UFPR (em português).

                                              xxxiii.      Instituto de Biologia Molecular do Paraná - Curitiba-PR(IBMP) (em português).

                                              xxxiv.      Laboratório de Bioinformática e Biologia Computacional (em português).

                                                xxxv.      Laboratório de Bioinformática da UTFPR (em português e em inglês).

                                              xxxvi.      Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS) (em português).

                                            xxxvii.      Núcleo de Bioinformática do Laboratório de Imunogenética (em português).

                                          xxxviii.      Grupo de Bioinformática Estrutural (em português).

                                              xxxix.      Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) (em português).

                                                          xl.      Laboratório de Biotecnologia Sustentável e Bioinformática Microbiana, IMPPG, (UFRJ) (em português).

                                                        xli.      Universidade Federal de Viçosa (UFV) (em português).

                                                      xlii.      Laboratório de Bioinformática do Bioagro (em português).

                                                    xliii.      Universidade de São Paulo (USP) (em português).

                                                    xliv.      Laboratório de Genética Molecular e Bioinformática (em português).

                                                      xlv.      LabPIB - Laboratório de Processamento de Informação Biológica (em português).

                                                    xlvi.      Universidade de São Paulo - Ribeirão Preto(USP) (em português)

                                                  xlvii.      Grupo de Bioinformática, Laboratório de Bioinformática - Departamento de Genética - Grupo do Prof. Wilson (em português).

                                                xlviii.      Grupo de Bioinformática, Laboratório de Bioinformática - Departamento de Genética (em português).

                                                    xlix.      Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (em português).

Referencias Bibliográficas para formatação do texto:

1. Attwood T.K., Gisel A., Eriksson N-E. and Bongcam-Rudloff E. (2011). Concepts, Historical Milestones and the Central Place of Bioinformatics in Modern Biology: A European Perspective. Bioinformatics - Trends and Methodologies. InTech. Página visitada em 8 Jan 2012.
2. 535980 A field guide to experts, BMJ (2004) 329:1460–1463.
3. [http://www.brainyquote.com/quotes/quotes/f/franklind125000.html There are as many opinions as there are experts. Franklin D. Roosevelt.].
4. Bioinformática, genes e inovação, Revista ComCiência 08/2003.
5. Bioinformatics: perspectives for the future, Genet. Mol. Res. 3 (4): 564-574 (2004).
6. Biological Sequence Analysis: Probabilistic Models of Proteins and Nucleic Acids. R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, and G. Mitchison. Cambridge University Press, 1998.
7. Computational Genome Analysis An Introduction, Richard Deonier, S Tavaré, and Michael S. Waterman, Springer Verlag, 2005.
8. L. Hunter. Life and Its Molecules: A Brief Introduction. AI Magazine 25(1):9-22, 2004. Uma versão mais antiga mas mais detalhada está como introduction to molecular biology for the computer scientist.
9. Livro WEB: Genomes, T.A. Brown.
10. Livro WEB: Molecular Cell Biology by Lodish, Berk, Matsudaira, Kaiser, Krieger, Scott, Zipursky, and Darnell.
11. Introduction to BioInformatics, Mark Craven, UW-Madison.
12. Computational Molecular Biology, Sean Eddy, Washington University.
13. Algorithms for Molecular Biology, Ron Shamir, Tel Aviv University.
14. Computational Molecular Biology, Doug Brutlag & Lee Kozar, Stanford.
15. Representations and Algorithms for Computational Molecular Biology, Russ Altman, Stanford.
16. MIT Open Courseware MO640/MC931 Biologia Computacional, João Meidanis, UNICAMP.
17. CONN, E. E.; STUMPF, P. K. Introdução a bioquímica. 4 ed. Tradução de J. R. Magalhães; L. Mennucci. São Paulo: Edgard Blücher, 1980. 525 p. Tradução de: Outlines of biochemistry.
18. LEHNINGER, A. L.; NELSON, D. L.; COX, M. M. Princípios de bioquímica. Tradução de W.R. Loodi, e A.A. Simões. São Paulo: Sarvier, 1995. 839 p. Tradução de: Principles of biochemistry.
19. VIEIRA, E.C.; GAZZINELLI, G.; MARES-GUIA, M. Bioquímica celular e biologia molecular. 2 ed. São Paulo: Atheneu, 1996. 360 p.

Bibliografia do Capítulo. Secção.

1. ALFENAS, A. C. et al. Eletroforese de proteínas e isoenzimas de fungos e essências florestais. Viçosa: UFV, 1991. 242 p.
2. BAUM, S. J.; BOWEN, W. R. Exercises in organic and biological chemistry. New York: Macmillan, 1972, 228 p.
3. CAMPBELL, M. K. Bioquímica. 3 ed. Traduação de H. B. Fenema et al. Porto Alegre: Artmed, 2000. 751 p. Traduação de : Biochemistry.
4. CLARK, J. M. Bioquímica experimental. Zaragoza: Acribia, 1966, 287 p.
5. COELHO, A. P. Práticas de bioquímica. 3 ed. Rio de Janeiro: Cultura Médica, 1979. 204 p.
6. *CONN, E. E.; STUMPF, P. K. Introdução a bioquímica. 4 ed. Tradução de J. R. Magalhães; L. Mennucci. São Paulo: Edgard Blücher, 1980. 525 p. Tradução de: Outlines of biochemistry.
7. COOPER, T. G. The tools of biochemistry. New York: John Wiley & Sons, 1977. 423 p.
8. GORNALL G.A.; BARDAWILL, J.; DAVID, M. M. Determination of serum proteins by means of the biuret reaction. Journal of Biological Chemistry, Bethesda, v. 177, p. 751 - 766. 1949.
9. GUIA dos trabalhos práticos de bioquímica. Belo Horizonte: UFMG. Departamento de Bioquímica - Imunologia – ICB, s.d. 45 p.
10. **LEHNINGER, A. L.; NELSON, D. L.; COX, M. M. Princípios de bioquímica. Tradução de W.R. Loodi, e A.A. Simões. São Paulo: Sarvier, 1995. 839 p. Tradução de: Principles of biochemistry
11. LITWACK, G. Experimental_biochemistry - a laboratory manual. 3 ed. New York: John Wiley & Sons, 1964. 313 p.

12. NOELTING, G.; BERNFELD, P. Sur les enzymes amylolytiques. III La beta amylase: dosage d'activité et controle de l'absence d'alfa amylase. Helvetica Chemical Acta, Basel, v. 31, p. 286 - 290. 1948.
13. PERRIN, D. D.; DEMPSEY, B. Buffers for pH and metal ion control. London: Chapman and Hall, 1974.176 p.
14. RAW, I.; COLLI, W. Fundamentos de bioquímica. Brasília: UNB, 1965. 133 p.
15. RENDINA, G. Experimental methods in modern biochemistry. Philadelphia: W. B. Saunders, 1971. 333 p.
16. SANTOS, C. D. Fisiologia e bioquímica da digestão em Erinnyis ello (Lepidoptera: Sphingidae). São Paulo: USP, 1985. 178 p. (Tese de Doutorado em Bioquímica).
17. SMITH, I. & FEINBERG, J. G. Paper e thin layer chromatography and electrophoresis. 2 ed. Glasgow: Bell and Bain, 1965. 241 p.
18. STRYER, L. Bioquímica. 4 ed. Tradução de A. J. M. da S. Moreira; J. P. de Campos. L. F. Macedo; P. A. Motta; P. R. P. Elias. Rio de Janeiro: Guanabara Koogan, 1996. 1000p. Tradução de: Biochemistry.
19. ***VIEIRA, E.C.; GAZZINELLI, G.; MARES-GUIA, M. Bioquímica celular e biologia  molecular. 2 ed. São Paulo: Atheneu, 1996. 360 p.

 Indicação de bibliografia de Bioquímica, livros, sugestões de leitura, guias, manuais.

• Manual de Bioquímica com correlações clínicas
• Autor: Devnin, Thomas M.
• Editora: Edgard Bluncher
• Biologia e Bioquímica
• Autor: vários autores
• Editora: Phorte Editora
• Bioquímica clínica para o laboratório
• Autor: Motta, Valter T.
• Editora: Medbook
• Bioquímica Ilustrada
• Autor: Champe, Pamela
• Editora: Artmed
• Bioquímica Básica
• Autor: Marzzoco, Anita
• Editora: Guanabara
• Princípios de Bioquímica de Lehninger
• Autor: Cox, Michael
• Editora: Artmed
• 4.000 questões de Farmácia e Bioquímica
• Autor: Carioca, Raimundo Nonato Azevedo
• Editora: Nilo Book
• Bioquímica de Alimentos
• Autor: Koblitz, Maria Gabriela Bello
• Editora: Guanabara
• Fungos, uma introdução a Biologia, Bioquímica
• Autor: Azevedo, João Lucio de
• Editora: Educs
• Bioquímica Médica
• Autor: Baynes, John
• Editora: Elsevier (Medicina)

Bibliografia geral para o Capítulo. Complemento.

1.      BERK, Z. Braverman´s introduction to the biochemistry of foods. 1. ed. Amsterdam: Elsevier, 1976. 315p.

2.      BOBBIO, F.O.; BOBBIO, P.A. Introdução à química de alimentos. 3. ed. São Paulo: Varela, 2003. 238p.

3.      BOBBIO, F. O; BOBBIO, P.A. Química do processamento de alimentos. 3. ed. São Paulo: Varela, 2001. 478p.

4.      BOBBIO, F. O; BOBBIO, P.A. Introdução à química de alimentos. 1. ed. São Paulo: Varela, 1989. 225p.

5.      CISTERNAS, J.R.; VARGA, J.; MONTE, O. Fundamentos de bioquímica experimental. 2. ed. São Paulo: Atheneu, 2001. 276p.

6.      COULTATE, T.P. Food: the chemistry of its components. 3. ed. Cambridge: Royal Society of Chemistry, 1996. vii, 360p.

7.      LEHNINGER, A.L.; NELSON, D.L.; COX, M.M. Princípios de Bioquímica. 2. ed. São Paulo: Sarvier, 2000. 839p.

8.      MORITA, T; ASSUMPÇÃO, R.M.V. Manual de soluções, reagentes e solventes. 2. ed., São Paulo: Edgard Blücher, 1986.

9.      REIS, M. Completamente Química. v.3. São Paulo: FTD, 2000. Coleção Completamente química, ciência, tecnologia e sociedade. p. 335-398.

10.  SOLOMONS, T.W.G. Química Orgânica, v.2. 6.ed. Rio de Janeiro: LTC, 1996. p. 354 - 496.

11.  REMIÃO, J.O.R.; SIQUEIRA, A.J.S.; AZEVEDO, A.M.P. Bioquímica: guia de aulas práticas. Porto Alegre: EDIPUCRS, 2003. 214p.

12.  ARAÚJO, J.M.A. Química de Alimentos: teoria e prática. 3. ed. Viçosa: UFV, 2004. 478p.

13.  UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ; DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA. Bioquímica: aulas práticas. 2.ed. Curitiba: Scientia et Labor, 1988. 116p.